胞內RNA與蛋白質結合情況的驗證: RIP
實驗意義
研究細胞內RNA與蛋白質的結合情況，有助于了解轉錄后調控網絡的動態過程，發現miRNA的調控靶點，可了解惡性腫瘤以及遺傳學疾病等整體水平的RNA變化以及轉錄后調控網絡的變化，應用于病理診斷及科學研究。
實驗原理及步驟
RNA結合蛋白免疫沉淀(RNA Binding Protein Immunoprecipitation, RIP)的基本原理是使用目標蛋白的抗體捕獲內源性的RNA-蛋白的復合物，然后通過免疫沉淀的方法把RNA-蛋白復合物一起分離下來，然后通過RT-PCR. RIP-Seq (高通量
測序)或RIP-Chip (microarray) 來鑒定結合的RNA序列。RIP流程如下圖
結果展示：
實驗周期及交付標準
1.實驗周期: 1-3個月
2.交付標準: RIP鑒定結果報告、分析報告、實驗報告(試劑、耗材、實驗步驟)、
原始數據等
需確認的信息
1.目的基因與蛋白信息。
2.是否提供抗體
3.樣本分組及分析要求
參考文獻
[1] Gagliardi M, Matarazzo M R. RIP: RNA Immunoprecipitation[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480:73.
[2] Meyer K，K?Ster T，Nolte C . et al. Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7[J] Genome Biology, 2017, 18(1):204.
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